V Cvernovke sídli manažment združenia a Integračný program Medzimiesto, v ktorom sociálni pracovníci a pracovníčky pomáhajú ľuďom na ceste z ulice prostredníctvom podporovaného bývania a prevencie. Vagus zároveň prevádzkuje najväčšie denné centrum pre ľudí bez domova na Slovensku, ktoré sídli na Račianskom mýte a pracuje v teréne s ľuďmi bez domova priamo na miestach, kde žijú. Vagus v Novej Cvernovke každoročne organizuje podujatie Noc vonku, ktorým poukazuje na problém bezdomovectva a chudoby na Slovensku.

Vagus tím tvoria ľudia, ktorí sa starajú o chod združenia, šíria povedomie o problematike chudoby a bezdomovectva na Slovensku a pracujú na systémových zmenách a sociálni pracovníci a pracovníčky, ktorí priamo pracujú s ľuďmi bez domova v 3 programoch Vagusu.